上海最好的醫(yī)藥大學主要有以下幾所：
1、復旦大學
復旦大學的醫(yī)學有基礎醫(yī)學院、上海醫(yī)學院、公共衛(wèi)生學院、藥學院、護理學院、生命科學學院6個醫(yī)學相關學院，有10個附屬醫(yī)院。
2、同濟大學
同濟大學的醫(yī)學有醫(yī)學院、生命科學與技術學院、基礎醫(yī)學院、預防醫(yī)學院、口腔醫(yī)學院、臨床醫(yī)學院6個醫(yī)學相關學院，有9個附屬醫(yī)院。
3、上海交通大學
上海交通大學的醫(yī)學有藥學院、生命科學學院、臨床醫(yī)學院、口腔醫(yī)學院、公共衛(wèi)生學院、護理學院6個醫(yī)學相關學院，有13所附屬醫(yī)院。
4、上海第二軍醫(yī)大學

是中國人民解放軍總后勤部直屬的一所為軍隊培養(yǎng)醫(yī)學專門人才及衛(wèi)生管理干部的全國重點醫(yī)科大學，有基礎部、海醫(yī)系、藥學院、衛(wèi)勤系、護理學院、心理與精神衛(wèi)生學系、熱帶醫(yī)學與公共衛(wèi)生學院、外訓系、中醫(yī)系這“一部八系”，有4個附屬醫(yī)院。
5、上海中醫(yī)藥大學
上海中醫(yī)藥大學有基礎醫(yī)學院、中藥學院、針灸推拿學院、護理學院、醫(yī)學技術學院、康復醫(yī)學院、5個臨床醫(yī)學院，共有11個醫(yī)學院，5個附屬醫(yī)院。